项目名称: 生物信息学服务平台 项目编号: ZBZXJJ******
公告开始日期: 2025-05-26 09:01:32 公告截止日期: 2025-05-29 10:00:00
采购单位:******大学 付款方式: ******银行账户,项目货款仅用于本进口项目的信用证或TT付汇及进口相关费用等。进口代理公司收到甲方合同货款后,按外贸合同要求及时履行与乙方委托的境外代理公司的付款义务。国产设备:甲方应在完成验收并建立固定资产后向乙方一次性支付本合同的总款项,乙方须向甲方出具合法有效完整的完税发票及凭证资料进行支付结算。
到货时间要求: 合同签订后7个日历日内
预算总价: ¥485000.00
收货地址:******大学望江校区
采购清单
采购商品: 生物信息学服务平台 采购数量: 1 计量单位: 台 所属分类: 服务器
品牌: 戴尔
型号: R750
预算单价: ¥485000.00
技术参数及配置要求: 1.硬件要求:1.1 处理器:支持两个第 3 代英特尔至强可扩展处理器(每个处理器多达 40 个核心)1.2 内存:32 个 DDR4 DIMM 插槽,支持最高2TB RDIMM或4TB LRDIMM,速率高达 3200 MT/s;可同时安装16条英特尔傲腾持久内存200系列,最大可达8TB1.3 存储控制器:内部控制器:PERC H745; 引导优化型存储子系统 (BOSS-S2):HW RAID 2 x M.2 SSD 240 GB;外部 PERC (RAID):PERC H8401.4 驱动器托架:正面托盘:12 x 3.5 英寸 SAS/SATA (HDD/SSD),最大可达 192 TB 1.5 电源装置 : 1400 W 白金 AC/240 HVDC1.6 风扇:风扇/高性能 SLVR 风扇/高性能金牌级风扇1.7 外形规格:2U 机架式1.8 安全性:加密签名固件;安全引导;安全擦除;硅片信任根;系统锁定(需要 iDRAC9 Enterprise 或 Datacenter);TPM 1.2/2.0 FIPS、CC-TCG 认证、TPM 2.0 中国 NationZ1.9 端口:前置端口 1 个专用 iDRAC Direct micro-USB ,1 个 USB 2.0 ,1 个 VGA*2.软件要求(必须满足项):2.1 操作系统和虚拟机管理程序:Canonical Ubuntu Server LTS2.2 OpenManage 软件:OpenManage Enterprise2.3 基础环境工具:Conda/Mamba:包管理与虚拟环境;Docker/Singularity:容器化部署;Snakemake/Nextflow:流程自动化管理2.4 数据预处理与质控:FastQC:原始数据质量评估;Trimmomatic:去接头与低质量序列;Cutadapt:引物/接头去除(支持扩增子);Fastp:快速质控(支持UMI);MultiQC:多样本质控报告整合2.5 基因组分析:2.5.1组装工具SPAdes:细菌/真菌短读长组装Unicycler:混合组装(Illumina+长读长)Flye:长读长组装(ONT/PacBio)Canu:长读长纠错与组装MEGAHIT:高效宏基因组短读长组装2.5.2组装评估与优化QUAST:Contig统计(N50/GC含量)BUSCO:基因组完整性评估CheckM/CheckM2:原核基因组质量检测Pilon:短读长纠错2.5.3注释工具Prokka:原核快速注释(基因/rRNA/tRNA)Bakta:高精度注释(含CRISPR/sRNA)Funannotate:真菌专用注释BRAKER:真核基因预测(结合RNA-Seq)2.5.4功能与进化分析eggNOG-mapper:COG/KEGG/GO功能注释antiSMASH:次级代谢产物基因簇预测CRISPRCasFinder:CRISPR识别Roary:泛基因组分析OrthoFinder:直系同源聚类FastTree/IQ-TREE:进化树构建Gubbins:重组区域检测2.6、扩增子分析(16S/ITS等)2.6.1核心流程QIIME 2:全流程分析(ASV/OTU、多样性)Mothur:经典OTU聚类流程DADA2(R包):ASV去噪Deblur:16S ASV生成2.6.2序列处理与分类VSEARCH:序列去冗余/嵌合体检测RDP Classifier:贝叶斯分类注释SINTAX:分类学注释(需USEARCH)2.6.3数据库SILVA:细菌/古菌16S数据库Greengenes:经典16S数据库UNITE:真菌ITS数据库2.7、宏基因组分析2.7.1组装与分箱MetaSPAdes:复杂群落组装metaHipMer:超大规模组装MetaBAT2:丰度与序列分箱MaxBin2:单拷贝基因分箱VAMB:深度学习分箱dRep:基因组去冗余2.7.2物种与功能注释Kraken2/Bracken:k-mer物种分类MetaPhlAn4:标记基因物种定量HUMAnN3:宿主-微生物通路分析DRAM:代谢潜能注释2.7.3抗性基因与代谢ABRicate:抗性基因筛查(CARD/ResFinder)DeepARG:深度学习抗性预测2.7.4可视化与统计Anvi'o:交互式整合分析STAMP:差异统计分析Krona:物种组成环形图2.8、公共数据库资源NCBI NT/NR:核酸/蛋白参考库KEGG/eggNOG/UniProt:功能注释库GTDB:基因组分型分类库CARD/ResFinder/VFDB:抗性/毒力因子库MGnify:宏基因组整合数据库2.9、辅助工具InterProScan:蛋白结构域注释MMseqs2:快速序列搜索聚类CoverM:基因组覆盖度计算PhyloPhlAn:系统发育树构建2.10、可视化工具ggplot2/ComplexHeatmap(R包):图表绘制iTOL:进化树高级注释Pavian:交互式结果展示
售后服务: 服务年限:60月;电话支持:7x8小时;商品承诺:原厂全新未拆封正品;质保期:一年;